A estereotaxia é um procedimento que localiza lesões cerebrais com alta precisão. O aparelho utiliza as coordenadas cartesianas para identificar a intersecção das três linhas perpendiculares  (altura, largura e profundidade). Assim, o procedimento indica um ponto em comum onde as três linhas passam, auxiliando o trabalho do neurocirurgião.

Por ter esta alta precisão, a estereotaxia é amplamente indicada para a realização de biópsias de lesões cerebrais profundos. O aparelho é colocado em volta da cabeça do paciente suas peças se movem até acharem o local exato para a inserção das agulhas ou dos eletrodos. A estereotaxia, por ser pouco invasiva, também consegue drenar cistos e hematomas.

Com a estereotaxia, a neurocirurgia funcional, responsável pelo tratamento de problemas que alteram o funcionamento do sistema nervoso, evoluiu muito nos últimos anos. Pessoas com distúrbios de movimentos (como a doença de Parkinson e tremores), epilepsias podem ser beneficiadas pelo procedimento.